O destino da humanidade esta nas maos e nas patas de uma versao bem diferente da turma da Misterios S.A.! Acompanhe Fred, Velma, Daphne, Salsicha e o superinteligente Scooby-Doo conforme eles descobrem mais sobre as ameacas bizarras que enfrentam todos os dias em SCOOBY APOCALIPSE! Uma visita a uma cidade aparentemente intocada pela praga de nanitas, que transformou o mundo em uma terra devastada e infestada de monstros, coloca-os no centro da tragedia. Para piorar, os mais novos integrantes, Cliffy e Daisy...