A interminavel batalha de Alita continua. Sem poder escapar de seu destino de lutas sem fim, a garota que se revoltou com o dominio da cidade aerea de Zalem vence a batalha contra o cientista insano Desty Nova. Porem, logo em seguida, Alita e pega desprevenida em uma cilada. E entao depois de um longo periodo adormecida, logo que desperta, ela se depara com o cadaver de Nova e uma Zalem tomada pelo caos. Neste mundo futuristico, onde tudo pode acontecer, Alita ira de encontro ao seu destino!