Com o desenvolvimento completo do dispositivo de disparo gravitacional pelas Industrias Toua, a capitao ordena a destruicao da Nave Mass Union. Entretanto, o cientista Ochiai, responsavel pelo grande desastre de cem anos atras, ressuscita a partir da Quimera numero dois e rouba o dispositivo. Para piorar a situacao, Nagate continua fora de combate devido aos seus ferimentos e um grande perigo se aproxima de Sidonia